Роль любого заповедника в
сохранении раритетной фауны определяется как его природными особенностями (размеры,
разнообразие и качество местообитаний), так и «человеческим фактором».
Последний или направлен на охрану природного комплекса (поддержание заповедного
режима), или противоречит этой задаче (разнообразные виды природопользования в
заповедной зоне и на близлежащих участках). Основной природный фактор,
определяющий роль Карадагского заповедника как резервата редких видов высокая
биологическая емкость территории, обусловленная разнообразием элементов рельефа
и растительного покрова (от степей до широколиственных лесов).
За 20 с лишним лет в заповеднике зарегистрировано 48 видов позвоночных, включенных в
Красную Книгу Украины, из следующих систематических групп.
Пресмыкающиесеся: желтобрюхий и леопардовый полозы; акклиматизирован
средиземноморский геккон. Птицы 35 видов. Гнездятся: хохлатый баклан (до 94
пар), балобан (2-3 пары), сапсан (до 4 пар), пестрый каменный дрозд (2 пары),
возможно змееяд.
Орнитофауна представлена 31 видом, в том числе
относительно регулярно зимущий здесь длинноносый крохаль, полевой лунь, черный гриф,
во время миграций желтая цапля, полевой лунь, змееяд, серый журавль, розовый
скворец. Млекопитающие 10 видов: большой и малый подковоносы, трехцветная
ночница, европейская широкоушка, нетопыри средиземноморский и кожановидный,
дельфины афалина, морская свинья и белобочка, барсук. К их основным
местообитаниям относятся следующие ландшафтно-биотопические элементы.
Лесостепные растительные сообщества: местообитание желтобрюхого и леопардового
полозов, кормовой биотоп балобана и сапсана; на участках с элементами скального
ландшафта гнездится пестрый каменный дрозд.
В не гнездовое время отмечено 9
редких видов птиц (относительно регулярно этот биотоп посещают полевой лунь,
сапсан, розовый скворец, в последние годы черный гриф). Скальные обрывы:
репродуктивный биотоп 7 редких видов геккона обнаружен в 2001 г. на прибрежных скалах у Кузьмичева Камня, где был акклиматизирован), хохлатого баклана
(карадагская гнездовая группировка вторая по численности в Крыму), балобана,
сапсана, малого и большого подковоносов, трехцветной ночницы. Особо ценны
береговые скалы как местообитание всех указанных раритетов.
Только здесь
гнездится хохлатый баклан и расположены основные убежища редких рукокрылых. Прибрежная
морская акватория: кормовой биотоп 12 редких зимующих и мигрирующих птиц (зимой
обычен длинноносый крохаль); круглогодичный кормовой биотоп хохлатого баклана;
встречаются все 3 вида дельфинов. Территориально максимальное разнообразие
раритетов приурочено к 7-километровой береговой зоне, где встречается как
минимум 22 вида, в т. ч. 12 в репродуктивный период (средиземноморский геккон,
желтобрюхий и леопардовый полозы, хохлатый баклан, балобан,
сапсан, большой и малый подковоносы, трехцветная ночница, 3 вида дельфинов)
